Ayo

Temat: Mrozone owoce
co ulegaja zerwaniu delikatne wiazania (mostki?) utrzymujace jej strukture III-rzedowa (przestrzenna), ktora z kolei odpowiada za funkcje enzymu. Im nizsza temperatura, tym mniejsza energia kinetyczna czastek i slabszy ich ruch, wiec mrozenie teoretycznie nie powinno uszkadzac bialek enzymatycznych. Jak jest w praktyce - nie mam pojecia :)
Źródło: topranking.pl/1561/mrozone,owoce.php



Temat: zwrot sekwencji aminokwasow - czy ma znaczenie?
thraxx wrote: | Czy jesli (...) Ma znaczenie. Struktura I rzędowa, determinuje strukturę wyższego rzędu, czy li będą to dwa zupełnie inne białka. Poza tym np. trójka UGA to kodon stop, a odwrotna AGU, to seryna, więc sam rozumiesz... Wydawalo mi sie, ze mowa o strukturze na poziomie _aminokwasow_ (patrz zreszta tytul postu), czyli np. o roznicy His-Ile-Gly i Gly-Ile-His. Krotko: ma, bo bialko ma przeciez koniec N i C, aminokwasy tez nie sa symetryczne. Wlasciwe sam sobie odpowiedziales zreszta. pozdro, Ania
Źródło: topranking.pl/1815/zwrot,sekwencji,aminokwasow,czy,ma,znaczenie.php


Temat: Symulacja III-rzędowej struktury białka
Czesc! Buddy Rich pisze: Proba, Czy mo?ecie polecia mi jaki program na PC do symulacji III-rzedowej struktury bia3ka na podstawie sekwencji aminokwasow. Ewentualnie czy kto mo?e mi to wygenerowaa na jakim innym sprzecie. Bardzo mi na tym zale?y. Dzieki. Sa programy na PC-ta np. Swiss-PDB-Viewer, ktore umozliwiaja dofitowanie modelu, w szczegolnosci jesli masz jakies pokrewne bialko o znanej strukturze. Mozesz wyslac sekwencje do http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html, gdzie na podstawie bazy znanych struktur - moga wygenerowac model - o ile Twoje bialko jest bardzo podobne do jakiegos o znanej strukturze. Na tej stronie jest ostrzezenie, ale...
Źródło: topranking.pl/1815/symulacja,iii,rzedowej,struktury,bialka.php


Temat: brak struktury IIrzedowej
: Mam pytanko. Jake bialko nie posiada struktury II rzedowej a posiada : pozostałe trzy. AFAIR to tylko trzeciorzędowej mogą nie posiadać. I - kolejność aminokwasów II - a-helix lub b-harmonijka (wynika z Irzędowej) III - wiązania dwusiarczkowe IV - pokrój ogólny A żeby nie posiadały IIIrzędowej struktury wystarczy by nie miały w sobie żadnych aminokwasów zawierających siarkę. Ale jeśli się mylę,...
Źródło: topranking.pl/1815/brak,struktury,iirzedowej.php


Temat: brak struktury IIrzedowej
III - wiązania dwusiarczkowe mnie uczono, ze mostki dwusiarczkowe sa elementem struktury pierwszorzedowej, natomiast  III rzedowa to układ helis i harmonijek wprzestrzeni natomiat IV to układ podjednostek białka, jeżeli są takowe a jerzeli chodzi o odpowiedz na pytanie jakie białko nie posiada struktury IIrzedowej to powiem moze z zartem : zdenaturowane;-)
Źródło: topranking.pl/1815/brak,struktury,iirzedowej.php


Temat: Ewolucjonizm Kontra Kreacjonizm
"King Kong" <nowey3.WYT@gazeta.plwrote in news:d3hqv3$cop$1@inews.gazeta.pl: KK I ty nieuku smiesz mi zarzucacparanoje??? Od kiedy to priony robia swoja dokladna replike???? One poprostu wplywaja na strukture biaka i je 'ODKSZTALCAJA' KPW??? Nie wykorzystuja do tego ZADNYCH monomerow jako budulca poprostu lacza sie z innym gotowym bialkiem i je ODKSZTALCAJA. Podobnie dzialaja bialka opiekuncze czy zmutowane opiekuncze.One poprostu pomagaja innym bialkom we wlasciwym przyjeciu struktury 2,3 i4 rzedowej. Podobnie dzialaja bialka ktore 'rozwijaja'polipeptyd podczas transportu bialek do mt. Czy teraz w koncy ptasi mozdzku to zrozumiales??? A jak nie to zapytaj duzurnego biochemika na racjonalistach!...
Źródło: topranking.pl/1815/ewolucjonizm,kontra,kreacjonizm.php


Temat: Symulacja III-rzędowej struktury białka
----- Original Message ----- From: Buddy Rich <budyr@poczta.onet.pl To: <pl-sci-che@newsgate.pl Sent: Saturday, June 03, 2000 8:12 PM Subject: Symulacja III-rzędowej struktury białka Prośba, Czy możecie polecić mi jakiś program na PC do symulacji III-rzędowej struktury białka na podstawie sekwencji aminokwasów. Ewentualnie czy ktoś może mi to wygenerować na jakimś innym sprzęcie. Bardzo mi na tym zależy. Dzięki. Zajrzyj do Łukasza Bieleckiego www.man.poznan.pl/~bielecki/mm.htm...
Źródło: topranking.pl/1817/symulacja,iii,rzedowej,struktury,bialka.php


Temat: zwrot sekwencji aminokwasow - czy ma znaczenie?
Czy jesli, dla danego bialka, sekwencje aminokwasow odwrocimy, tzn. zamiast z lewa na prawo to ustawimy je dokladnie odwrotnie, tak jakby lustrzane odbicie, to czy ta sekwencja zwinie sie w dokladnie taka sama konformacje - strukture 3-rzedowa? Wiem wprawdzie, ze aminokwasy nie sa przeciez symetryczne i lacza sie ze soba   na zasadzie gniazdka i wtyczki, ale czy patrzac "z zewnatrz", czyli gdy bialko zaczyna sie zwijac, to czy zwrot ma tu jakiekolwiek znaczenie?
Źródło: topranking.pl/1817/43,zwrot,sekwencji,aminokwasow,czy,ma,znaczenie.php


Temat: zwrot sekwencji aminokwasow - czy ma znaczenie?
Czy jesli (...) Ma znaczenie. Struktura I rzędowa, determinuje strukturę wyższego rzędu, czy li będą to dwa zupełnie inne białka. Poza tym np. trójka UGA to kodon stop, a odwrotna AGU,...
Źródło: topranking.pl/1817/43,zwrot,sekwencji,aminokwasow,czy,ma,znaczenie.php


Temat: dlaczego bialko sie nie scina II
Piotr Wisniewski wrote: Widząc burzliwą dyskusję, jaką wywołał temat o gotowaniu mleka, chciałbym zaproponować pewną odmianę. Skoro okazało się, że w białko w mleku jednak się ścina, może wyjaśnicie, jak to się dzieje, że u bakterii czy innych równie prostych organizmów żyjących w ekstremalnych warunkach temperaturowych ani białka ani kwasy nukleinowe nie ulegają denaturacji. Problem jest to (dla mnie) wielki, ponieważ zgodnie z tym co uczą w szkołach energia wiązań wodorowych, Van der Waalsowskich i innych utrzymujących wyższe struktury biologicznych makrocząstek jest porównywalna z energią ruchów termicznych w temperaturach 30-60 stopni C. Zgodnie ... biochemii przychodzi tylko do glowy, ze te bakterie maja bialka, w ktorych III-cio rzedowa struktura jest tworzona nie przez wiazania wodorowe tylko np: disiarczkowe. ALe wtedy i tak pozostaje problem DNA....
Źródło: topranking.pl/1817/dlaczego,bialko,sie,nie,scina,ii.php


Temat: Otwieram SPUSP
Uzytkownik "Bogdan Szenkaryk" <pin@yoda.legnica.tpsa.plnapisal w wiadomosci Proponuje zabrac sie za symulacje struktury 3-cio rzedowej bialek. Od razu z grubej rury. To bedzie prawdziwy test "teorii" polowej Pinopy. wszystkiego dobrego ;-) ksmx...
Źródło: topranking.pl/1819/otwieram,spusp.php


Temat: odpowiedzi biologia rozszerzona
białka potem sie zastanawiełem nad komplementarnoscia 5' do 3'
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,157,62228005,62228005,odpowiedzi_biologia_rozszerzona.html


Temat: odpowiedzi z chemii rozszerzonej
kwas może doprowadzić do rozerwania tej struktury. A tak wogóle to nie sądzicie, że matura była bardziej humanistyczna, niż ścisła?:D Chodzi mi tu głównie o fize, bo ja po rozszerzonej miałem...
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,157,24239488,24239488,odpowiedzi_z_chemii_rozszerzonej.html


Temat: nowa mnie w szkole chce wywalic...
4- rzędową białek. Też jestem samcem, ale nie wyobrażam sobie sytuacji, w której, zależy ode mnie los 1000 uczniów a ja się kieruję "małą główką". To wszystko jest chore!!!
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,245,18715737,18715737,nowa_mnie_w_szkole_chce_wywalic_.html


Temat: świat jest coraz pięknieszy ?
DNA nabłonek pąłski w jamie ustnej faktycznei łatwo sie łuszczy i łatwo rozwala (bo jest płąski) detergeent otwiera błony komórkową i jadrową ale .. alkohol wytrąca struktury 3 i 4 rzędowe takze DNA ale to co widzisz to chyba wytracone białka? ale nie wiem . jak masz ze źródła wiarygodnego to pewnei tak jest (ja tylko spekuluję) tak czy ibnaczej wiem o...
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,210,52916961,52916961,swiat_jest_coraz_pieknieszy_.html


Temat: 100% melaminy
aminokwasy, a nie całe białka. IMO nie ma to żadnego wpływu na wartość odżywczą. Ponadto nie nazwałabym tych fal "nuklearnymi" bo nie jonizują.
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,572,85200033,85200033,100_melaminy.html


Temat: Chemia - 3 zadania . Pilne ;)
I Rzedowa struktura bialka Czekam na jakies sensowne odpowiedzi bez glupich komentarzy
Źródło: topranking.pl/928/chemia,3,zadania,pilne.php


Temat: PC Kurier. Microsoft. Marketing. Genialne.
ma jakąś okresloną strukturę (kąty, długości wiązań) przez co powstaje twór tak poskręcany, a nie inaczej, a komplikacja wynika z tego że zawsze w środowisku znajdują się jakieś dodatkowe cząsteczki, jony, które dalej to wszystko modyfikują, ale nie mogłyby modyfikować gdyby cząsteczka białka nie miała takiej, a nie innej budowy (zamknięte koło) i tak tworzy sie struktura IV-rzędowa. W sumie przewidzieć to...
Źródło: topranking.pl/1330/pc,kurier,microsoft,marketing,genialne.php


Temat: Mitochondrium
strukturalne" (te kilkaset aminokwasow sfaldowanych w okreslone struktury 2 i 3 rzedowe) to istne molochy! Owszem, mozesz sobie szukac w odpowiednich bazach danych (np. tu: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi? db=structure&cmd=search&term=cytochrome )ich 3d modeli: czaszowych, ... Pani nie chodzilo o wzory cytochromow lecz grup hemowych, bedacych grupami prostetycznymi w centrach aktywnych tych bialek. W odroznieniu od wzorow cytochromow, ich wzory strukturalne sa juz przyswajalne dla zmyslu wzroku...
Źródło: topranking.pl/1815/52,mitochondrium.php


Temat: brak struktury IIrzedowej
Hej Mam pytanko. Jake bialko nie posiada struktury II rzedowej a posiada pozostałe trzy. pozdr Maja
Źródło: topranking.pl/1815/brak,struktury,iirzedowej.php


Temat: Ewolucjonizm Kontra Kreacjonizm
dedlamen <dedalmen1@__REMOVE__gazeta.plnapisał(a): "King Kong" <nowey3.WYT@gazeta.plwrote in news:d3hqv3$cop$1@inews.gazeta.pl: | KK | I ty nieuku smiesz mi zarzucacparanoje??? | Od kiedy to priony robia swoja dokladna replike???? | One poprostu wplywaja na strukture biaka i je 'ODKSZTALCAJA' | KPW??? | Nie wykorzystuja do tego ZADNYCH monomerow jako budulca | poprostu lacza sie z innym gotowym bialkiem i je ODKSZTALCAJA. | Podobnie dzialaja bialka opiekuncze czy zmutowane opiekuncze.One | poprostu pomagaja innym bialkom we wlasciwym przyjeciu struktury 2,3 | i4 rzedowej. Podobnie dzialaja bialka ktore 'rozwijaja'polipeptyd | podczas transportu bialek do mt. | Czy teraz w ... TYLKO na bazie TEGO SAMEGO genu czy zduplikowanego (wystepujacego w wielu kopiach w genomie).Tutaj ma miejsce ZMINA KSZTALTU bialka prionowego a nie powstawanie jego DOKLADNEJ repliki! Teraz zaczniesz kapowac i przestaniesz...
Źródło: topranking.pl/1815/ewolucjonizm,kontra,kreacjonizm.php


Temat: Wysalanie białka.
Czy wysalanie kazeiny zmieni jej III-rzędową strukturę. Proszę o logiczne odpowiedzi.
Źródło: topranking.pl/1817/wysalanie,bialka.php


Temat: Pieczeńze wściekłych chomików
potwierdzało przypuszczenia autorów pracy. W niższych temperaturach chorowały prawie wszystkie. Tutaj "tylko" 5 na 33 (15+18). : A swoja droga - jakie struktury maja szanse przetrwac 300*C : przez 15 min? ... uporządkowanie struktur organicznych. Można się także dopatrzyć zasad mechaniki kwantowej (prawdopodobieństwo zdarzenia). Nie mówi się, że coś jest ale, że zaistnienie "tego" w takich warunkach jest na tyle i tyle prawdopodobne. :))). Czynnik obalający dogmat o strukturze III rzędowej uwarunkowanej I rządową przesunął się już ku tajemniczemu czynnikowi nieorganicznemu - znów pocztątki życia się kłaniają. Warto też przejerzeć Pawle jeszcze raz rozdział...
Źródło: topranking.pl/1818/pieczenze,wscieklych,chomikow.php


Temat: Darwin do poprawki:)
Kalmodulina jest to białko modulatorowe, powszechnie występujące w organizmach eukariotycznych, które działa w obecności jonów wapnia (Ca2+). Kalmodulina przyłącza cztery jony wapnia powodując zarazem zmianę swojej konformacji, w wyniku czego powstaje kompleks, który aktywuje i stymuluje działanie wielu enzymów (np. kinazy II, która fosforyluje wiele różnych białek), pomp błonowo-jonowych i innych białek. Dlatego należy sądzić, że tak jak w przypadku większości innych białek, także struktury konfiguracji przestrzennej kalmoduliny oraz miejsca przyłączenia 4 jonów wapnia, decydujące tylko o jej aktywności enzymatycznej są przekazywane również tylko dziedzicznie. Wynika z tego że dzioby darwinowskich zięb, sztandarowy...
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,32,67009976,67009976,Darwin_do_poprawki_.html


Temat: Kod genetyczny - entropia itp.
alfa zazwyczaj lokują się w błonie komórkowej, zależnie od położenia tych struktur w genie białko będzie zakotwiczone w błonie lub transbłonowe. Dalej: gdy wyróżnimy np. 7 kolejnych struktur alfa to najprawdopodobniej ... białko kodowane przez ten gen pełni daną funkcję. Inne informacje otrzymamy analizując sekwencje promotorowe genu - dowiemy się w jakiej tkance, czy nawet w jakich sytuacjach gen ulega transkrybcji. Oczywiscie nie uda nam się w ten sposób "rozgryźć" każdego genu - bardzo dużo jeszcze nie wiemy. Inną stroną medalu jest to że białka działają w komórce - gdzie są tysiące współdziałających ze sobą białek, mało która cecha więc jest naprawdę jednogenowa (chyba że chodzi o jakis poważny defekt). Jednakowoż smiem twierdzić, że bardzo dużo o kodzie DNA już wiemy, a z każdym dniem...
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,32,533275,533275,Kod_genetyczny_entropia_itp_.html


Temat: "krnabrne" sekwencje
albo tylko jakis okreslonych parametrow liczbowych ostatecznych > bialek. Ewentualna, chocby czesciowa, znajomosc takich zaleznosci bylaby > ogromnie wazna np. w przemysle farmaceutycznym, bo pozwalalaby na znacznie > szybsze i precyzyjniejsze otrzymywanie enzymow o zadanych wlasnosciach, czyli > bardziej skutecznych lekow! Ejze, nie jest tak zle. Znajac strukture pierwszorzedowa, mozna calkiem dokladnie przewidziec drugorzedowa. Na poziomie trzeciorzedowej sprawa sie komplikuje, mowiac dokladnie ... centrow aktywnych enzymow (a wiec struktury trzecirzedowej) jest juz calkiem zaawansowane. Nie robi sie tego jednek softwarem dostepnym komercyjnie, firmy farmaceutyczne maja z reguly swoje wlasne programy, zaawansowane w stopniu o...
Źródło: forum.gazeta.pl/forum/w,32,664448,664448,_krnabrne_sekwencje.html


Temat: Denaturacja
konformacji bialka jest niemozliwych, ale za to kazdy aminokwas ma pewne kontinuum konformacyjne). Jesli przejscie miedzy nimi zabiera ok 100 fs, to odnalezienie konformacji minimalnej moze zabrac do 10^27 lat. Fajnie, co? Ponadto w rzeczywistosci bywa tak, ze roznice energetyczne miedzy odleglymi konformacjami sa znikome, ponizej bariery termicznej majacej kilka kJ/mol. W procesie renaturacji najlatwiej zwija sie struktura drugorzedowa, bo duza role odgrywaja sily miedzy sasiednimi aa. U niezbyt duzych peptydow w czasie 4 ms zwija sie 40% a-helis, po 1 s - wszystkie. Ale i wtedy bialko nie jest natywne - dopiero gdy poszczegolne elementy drugorzedowe i superdrugorzedowe odpowiednio sie ustawia, bialko znajdzie sie w swojej natywnej, i stabilnej, formie (co moze trwac do 10 s) Jesli lancuch jest dlugi, to moze sie zdarzyc, ze sekwencje drugorzedowe beda sie zwijaly inaczej - np helisa zacznie sie za wczesnie lub za pozno itp, co uniemozliwia juz poprawne zlozenie bialka. A nawet wlasciwa struktura II-rzedowa czasem ... bariera. Np rozpuszczalnik wciska reszty hydrofobowe do srodka, a tam powinna byc akurat kieszen hydrofilowa... W duzych bialkach wyrozniamy zatem stadium tzw klebka statystycznego - czyli lancucha, majacego zachowane natywne str. II-rzedowe, ale bezladnie i przypadkowo poukladane wg lokalnych minimow energetycznych. Jest to etap posredni w denaturacji, i niestety koncowy przy renaturacji (o ile bialko nie zlepi sie w ogole w nierozpuszczalne agregaty). Przyroda radzi z tym sobie fantastycznie, dzieki zaangazowaniu calego szeregu bialek, asystujacych przy syntezie nowego peptydu i zapobiegajacych niewlasciwym ulozeniom, enzymom ustawiajacym mostki siarczkowe, obrobce po- i wspoltranslacyjnej. Dzieki czemu nie trzeba czekac tych 10^27 lat na czasteczke, a nad foldingiem bialek i przewidywaniem struktur ciagle lamia sobie zeby powazni uczeni ;) Ale to juz zupelnie nie moja dzialka, moze ktos ... "Wstep do inzynierii bialek" prof Wawrzynow.
Źródło: topranking.pl/1815/16,denaturacja.php


Temat: Teoria ewolucji
) Prosimy o wykonanie prostego kuchennego eksperymentu polegajacego na powolnym schlodzeniu jajecznicy koniecznie ze zdjeciami pokazujacymi jej powrot do stanu rozbitego jajka. Mówisz o strukturze IV rzędowej która oczywioście nie ulega renaturyzacji. Prawdę mówiąc zachowujesz się jak dziecko: Skoro jajejecznica nie wraca do punktu wyjścia to renaturyzacja wg ciebie nie istnieje. Zapewniam cię że jest inaczej a w jajku białkiem jest żółtko a nie tzw.białko :) Z drugiej strony protein folding and refolding to nie sa 'najnowsze badania' tylko nawet pobieznie patrzac na google scholar znajdujesz papiery z poczatku lat 90tych. Czyli jednak...
Źródło: topranking.pl/1815/teoria,ewolucji.php


Temat: Pieczeńze wściekłych chomików
mozgu). : : Nieorganiczne na pewno moga to przetrwac. : : Ale czy moga organiczne. Bialko w szczegolnosci? A oznaczales kiedys np. ile otrzymales osadu (standardowe doswiadczenie z siarczanem baru) z ... praca wlasnie dla : fizjologa a nie biochemika. Obawiam sie, ze mechanizm jest czysto biochemiczny :)) : Czynnik nieorganiczny, ktory indukuje : uporządkowanie struktur organicznych. : : Coz w tym dziwnego? Kofaktory organiczne czy nie stabilizuja : struktury bialek. Dziwne jest tylko to, ze ten kofaktor jest : najwyrazniej odtwarzany przez ta zmieniona forme bialka. W 600*C kofaktor organiczny? : Czynnik obalający dogmat o strukturze III : rzedowej uwarunkowanej I rządową przesuną3 : sie ju? ku tajemniczemu czynnikowi : nieorganicznemu - znow pocztątki ?ycia sie k3aniają. : : To naprawde moze nie miec nic wspolnego z poczatkami zycia : (i pewnie nie ma). Czemu sie tak uparles? Struktury : trzeciorzedowe bialek to dopiero nte z rozwiazan, ktore : musialy zostac odkryte przez ewolucje zanim...
Źródło: topranking.pl/1816/pieczenze,wscieklych,chomikow.php


Temat: Pieczeńze wściekłych chomików
z mozgu). Nieorganiczne na pewno moga to przetrwac. Ale czy moga organiczne. Bialko w szczegolnosci? Ot ju? pisa3em (w innej wiadomoci) poznanie tego czynnika mo?e zbli?ya nas do poznania zagadki początkow ... dla fizjologa a nie biochemika. Czynnik nieorganiczny, ktory indukuje uporządkowanie struktur organicznych. Coz w tym dziwnego? Kofaktory organiczne czy nie stabilizuja struktury bialek. Dziwne jest tylko to, ze ten kofaktor jest najwyrazniej odtwarzany przez ta zmieniona forme bialka. Mo?na sie tak?e dopatrzya zasad mechaniki kwantowej (prawdopodobienstwo zdarzenia). Nie mowi sie, ?e co jest ale, ?e zaistnienie "tego" w takich warunkach jest na tyle i tyle prawdopodobne. :))). Uwazaj bo skonczysz jak Penrose. Czynnik obalający dogmat o strukturze III rzedowej uwarunkowanej I rządową przesuną3 sie ju? ku tajemniczemu czynnikowi nieorganicznemu - znow pocztątki ?ycia sie k3aniają. To naprawde moze nie miec nic wspolnego z poczatkami zycia (i pewnie nie ma). Czemu sie tak uparles? Struktury trzeciorzedowe bialek to dopiero nte z rozwiazan, ktore musialy zostac...
Źródło: topranking.pl/1818/pieczenze,wscieklych,chomikow.php